另一个宇宙，另一个星球……
亚克伊尼克王国渡过了160年的和平生活之后，再次面临危机。
160年前，被称“暗之魔人”的怪物突然现身了，他的目的在于吞食王国境内丰富的能源物质——比邱塔特。就在这危机之秋，亚克伊尼克国国王毅然决定，用公主的力量召唤传说中的英雄。于是一位名叫武藏的二刀流剑士出现了。与暗之魔人激战之后，他成功地夺下了魔人的光之剑——兰罡多，并将魔人封印。在返回自己的世界之前，武藏把兰罡多封印在了螺旋塔。
今天，与亚克伊尼克王国断交的邻国——鲁·科阿尔帝国突然挑起战火，夜袭亚克伊尼克镇。公主弗莱姬（フイ-レ姬）沿袭古老的召唤术，将另一个宇宙里的武藏拉到王宫。身负就国重任的勇敢剑士武藏，突破帝国军的阵线，直奔螺旋塔而去……
第一章
路上的敌人并不太强，注意熟悉他们的攻击方式。一些石块可以推开，挡路的雕像可以打碎。途中会有一条小河当住武藏的去路，此时要吸收帝国手枪兵的特级“怒气炮”（ガンもどき），用它射击立在对岸的圆木即可搭起桥。在螺旋塔前，将四周的石像逐打碎，并塔上每个石像下面的圆形印记就能使螺旋塔重新浮出水面。
避开几个磙子，武藏来到螺旋塔内部。只见一口大钟被吊在半空，那么先爬到顶部，用怒气炮射断绳索，钟就会落下去压住火焰。穿过尽头的门，武藏被传送到塔顶。
目前兰罡多还被结界包围着，先要吸收塔顶上帝国兵的特级“刀背打”（みねうち），再把其中一个引到开关上，随后马上用“刀背打”将其打晕，这样武藏就有时间去拔兰罡多了。
光之剑兰罡多刚一苏醒，螺旋塔顶的头像就滚落下来，武藏只有拼命逃跑，连头也不敢回。躲过一个个挡路的帝国兵和石块，跳过一根根圆木，他总算撞进了王宫。可是鲁·科阿尔帝国的波尔多少尉（ボルド-少尉）已抢先一步攻了进来，并抓住了弗莱姬公主。武藏虽然学会了兰罡多的第一个特技——回旋斩，却被帝国的机器巨人“蒸汽骑士”（スチ-ム·ナイト）拦住了去路。
要打败这个BOSS首脑得攻击它的腿，而且在腿部喷出蒸汽时是不能靠近的。每打坏一条腿它都会暂时瘫痪，利用这点儿时间用兰罡多猛打它身上的绿色亮点。每打光它一条血就上前把它扔出去。蒸汽骑士共有三条血，到第三条时它会用身体压袭武藏。而每次落地时亮点就会出现。要看好落点，最终，蒸汽骑士被扔下了山崖，而武藏自己也累得昏迷不醒。
第二章
武藏一觉醒来，发现身处一间陌生的房子内，总管雷班（使用人头レバン）和执事尤凯尔（执事ユッケル）前来探望，并告诉武藏，城里的许多人都被封进了绿水晶，散布在王国境内的各个地方，要用兰罡多才能打破封印。同时他们希望武藏能够尽快地救回弗莱姬。武藏先来到图书馆见了哈奇诺司祭（ハ-チノス司祭），从藏书中读到有关160年前武藏借助五轮书的力量战胜暗之魔人的传说，以及能源物质比邱塔特等资料。接着就顺缆车钢索滑到双子山（ふたご山）山口处，沿山坡向下进入阿米亚克伊村（アミヤクイ村）。
从写有此处禁行（この先行き止まり）的牌子处出村，可以在林间空地找到一块绿水晶，依照总管雷班的介绍用兰罡多劈开后救出鹰匠托克森（鹰匠トクセン）。
从写有蒸气树之森（スチ-ムウッドの森）的路标处出村，右拐进入蒸汽树之森，跳上某根通向左侧林中的输汽管，在深处可救出夜色卡盖恩乐手（フ-リッシモ乐士）。返回先前的干道向前继续走，有根通向右侧森林的管道，沿着它走上岩石，在尽头处救出曲艺师纳姆尔（曲艺师ナムル）。
从写有睡魔森林（すいまの森）的路标处出村，在水池旁有一环形小路，武藏在那里可以救出纳米罗斯（见张りのナミロス）。之后他会去把守双子山的入口。
在蒸汽树之森入口处向左进入睡魔森林，走过两座木桥并向上方前进，找到写有“この先さまよいの森 キケンにつき立入禁止”的木牌，吸收右边妖花的特技“跳步”（ホッビング），就能冲上妖花右上方的岩石，救出占卜师吉亚拉（占い师ギアン）。此后，武藏回城与她交谈就能得知下一部五轮书的大概位置以及其他被困居民的所在地。跳上绿水晶旁边的管子，在另一头的宝箱中可以拿到裸露的肩膀（すかしのカタヌキ）。
找到村长并与他交谈，武藏作了自我介绍，治理村长（オサメル村长）也对兰罡多的现世感到惊讶。他说村子里的一只小狗雷诺（レノ）不见了，似乎从双子山方向传来过它的叫声，希望武藏能帮忙找回来，然后又谈及了五轮书的事。
进山后拐向左边的双子山方向（ふたご山方面），救出士兵巴拉尼克（兵士バラニック）。在河心的岩石上发现了走失的小狗。先把它举起再投到岸上，并把它运回村子即可（注意最后几步一定要举着狗走，直到自动放下切换画面）。
看见小狗已跑回村子，武藏便又敲开了村长家的门，可得到的答复是去找村子边上那个被锁住的男人，据说他知道有关五轮书的情报。那人又恳求武藏给他些面包和水，他已经快不行了。面包房里有的是面包，任选一种即可，而水（いどみず）则要调查教堂外的水井来取得。备齐两样物品再与那男人交谈，才知道他叫约翰（シャン）。紧接着他又求武藏帮他逃走。不得已答应下来，他便让雷诺去彷徨森林（さまよいの森）给武藏带路，并说好在入口处会合。
在救出占卜师吉亚拉的地方吸收跳步特技，越过荆棘丛，原来雷诺早已等在那里。彷徨森林是个充满迷幻色彩的地方，场景大致相同又有思维差别，如果迷路只要向下走就会马上回到入口处。不过雷诺可以靠嗅觉认路，并在正确的路口处狂叫。不久，前面出现一片墓地，武藏推开左上方的墓碑，取得了约翰的钥匙（ジャンのカギ）。
回到村里见到了约翰，他请武藏在零点时替他打开枷锁。照办之后约翰十分高兴，让武藏先去收集4根圆木，然后去双子山找他。
前往双子山，原来跳不过去的地方长出了浮萍。转过河弯，武藏又救出了佣兵米诺（佣兵ミ-ノ），并利用竖立在河中的三根木杆跳过河对岸。钻过一个山洞之后是一座陈旧的吊桥（最好晚上过桥，否则远处山上有抢手攻击），从某根绳索爬下去落到河心的礁石上，可以救出马房管理员巴萨西（马屋番バッサシ）。以后回城与他谈话可知世上仅存13只敏克（ミンク-），而且武藏找到的每只敏克都会送到他那里饲养起来。
爬回吊桥，穿过石洞，武藏在岸边找到一棵枯树，用回旋斩可以将其砍倒，于是第一根圆木（まろた）到手了。在去往山顶的路上还有三棵枯树，物品栏里需留出空格。武藏跳上化骨龙的尾巴向山顶爬去，中途救出了骑士拉德（骑士ラ-ド）和工匠茨凯冈戴儿（大エツケコンデル），最后在一座小桥上遇到了约翰。他用4根圆木制成了木筏，让武藏乘着它漂流而下，去寻找传说的武具。
在急流中某路口右行可到达一处平静的水面，岸上的绿水晶里封着摩尔恩医师（モルホン医师），救出他之后，每次回城与之交谈即可全回复HP和BP。最后，武藏在宝箱中找大弁庆的气息（ベンケイブレス），这正式传说的武具之一。有了它武藏就可以借助双剑攀爬暗红色的软质岩壁了。
双子上入口的右侧就是能攀爬的岩壁。武藏在顶上遇见了惊慌失措的菲里斯（フィレス），原来蒸汽树快要爆炸了，他把蒸汽树的手册（スチ-ムウットのメモ）塞给武藏，希望传说中的勇士能够化解危机。可是离爆炸时间只有24小时了~
立即前往蒸汽树之森，爬上尽头的岩壁，来到动力中心——蒸汽树。转动大门上的阀门时，屏幕上会出现两个竖槽，左边的会自动充满，当到达写有OK字样的绿色区域时按下“□”键，右边的槽才被填充，直到右边的槽被充满，阀门才算调好。在蒸汽树内部共有8个阀门，都是同样原理。但必须按从1到8的顺序来转动，而且调好相邻两阀门的间隔时间不能超过60秒，否则就要从头开始。
经过一番紧张的工作，武藏终于关闭了所有的阀门，刚走出蒸汽树，菲里斯（フィレス）正好赶到，他十分感谢武藏的帮助。回村之后，村长为了表达谢意，为武藏提升了25点HP上限。此时，蒸汽树之森里已不再喷出蒸汽，睡魔森林中的那道蒸汽墙也消失了，它背后的空地上悬浮着封有女清洁工乔米诺（扫除妇ジョミ-ノ）的绿水晶。打碎之后再回城找她谈话可以习得必杀技——前冲不归刺（ダッシュつき）。
武藏重返双子山的途中，正撞见波尔多少尉。为了抢夺五轮书，二人展开了一场攀岩赛！最终，武藏凭借人小身轻的优势胜出。
山顶上安放着五轮书·地之卷的石板，用兰罡多将其劈开的同时，地之力也被吸收进来。它可以使周围的敌人暂时静止，也能震落某些巨型的石球。
回城与执事尤凯尔（执事ユッケル）交谈（选あんかいにいく），他马上吩咐士兵拉尼克、佣兵米诺、工匠茨凯冈戴尔和骑士拉德配合武藏前往地狱谷山口（ヘルズベレ-）。进双子山入口后右转，用地之力震落巨石填满深坑，武藏就出布系维塞特（布系ビセット）之后发现一个被堵住的入口。这时，另外4人分别踏上4个开关，打开了通道。前面的盆地里正是封印着地之纹章的妖兽。
对付这个BOSS必须看准时机，用地之力震落助手们运来的石块，利用这段时间抽出兰罡多击打它口中的绿色发光球题。不久，武藏就又一次做出了胜利姿势，同时，地之纹章解放了。
第三章
大胜而归的武藏从骑士拉德那里习得了必杀技：“十文字斩”（じゅうもんじぎり）。可是当他走进阿米亚克伊村时，却发现这里被恐怖气氛所笼罩。与喷泉旁的村长和莱特（宿屋のレント）交谈得知有吸血鬼在村中出没，已有两个孩子遇害，只有万能药才能救他们，可是万能药中所必须的贪婪之水（いやしの水）和幻之花（まぼろしの花）又很难取到。武藏自是义不容辞，决定先去矿坑深处的地底湖找后者。而矿坑的钥匙在风车看守者（ウィドじいさん）手里（23：00以后他才会开门）。打开木门，第一个路口向右拐（ピンチョタイト采掘场方向），不久会见到一台大型排气扇。在它停转的时候跳下竖井，向写有“地底湖方面”的路标方向前进。在布满传送带的洞穴里救出师傅马尔德雷（亲方マ-ダレ-）和骑士尼克（骑士ニツク）（从后者身上可习得必杀技：爆裂劈（まきわりダイナマイト）。很快前面闪出一片波光，只见湖中心竖起一座小岛，幻之花就在顶部，但只有在3：00~7：00之间才能采摘。在岛上和岸边还能救出厨师利普（食事系リブ）和啤酒监督（ピ-ル监督），宝箱里面是军人手套（どんじんてぶくろ）。
回到排气扇下面，武藏按照提示牌的指示顺洞壁爬到扇页上面。村长拿到幻之花非常高兴，告诉武藏赶快前往双子山取贪婪之水。
双子山上，武藏刚走进那个有间歇瀑布的山洞就看见宿屋的莱特倒在地上。谈话中选第一项就要在12小时内取回贪婪之水救他（选第二项是把他送回村子），事不宜迟，武藏飞快地冲向山顶。过了先前与约翰会面的小桥，他用地之力震落一块岩石，从而跳上伸出山体之外的横杆，若干个大回环之后终于在山顶的天池边取得贪婪之水。另一条支路也可以达顶，且有宝箱，可取得玻璃球（ガラスだま）。回村后，众人为表达谢意，把老翁蜜柑（おおきなミカン）送给武藏。
到了下午18：00，面包房的布雷德（パン屋のブレッド）突然来敲酒场的门。可是由于吸血鬼的出现酒场已停业，老板娘布勒尔（タンブラ-）已经住进宿屋。送走布雷德，武藏来找坦布勒尔和另一个常见的酒客交谈（はなす为交谈），得知酒场的地下经常传来可怕的声音。到了午夜零点，果然有许多怪物从酒场里走出。由于攻击没有效果，武藏就趁门被打开的机会溜进屋内，发现一条通向地下的密道。想不到的是，达克雷（酒场のダクレイ）已先行一步，他把武藏带一堵墙前，说后面隐藏着秘密，希望他能解除墙上的符咒。
达克雷所在大厅和对面走廊尽头的大厅一共开有4个门，每个门里有一个符咒，要用兰罡多破除，4个符咒全部解开之后达克雷背后的墙才会打开。在这之前他会为武藏进行全回复。现定义达克雷右手侧的门为1号，左手侧为2号，对面大厅里与1号门在同侧的门为3号，另一个为4号。
1号门里有许多滚石花，从它们身上可吸收特技“保龄球”（ボウリング），用它能撞开有裂缝的墙壁，但有些裂痕在巨花背后，或是在侧面墙上，需仔细观察。有一处开关被踩下后会有一批怪兽降下，用保龄球特技把它们尽数打倒才能通过。有扇门会被喷火器堵住，用回旋斩才能击碎。最深处那蓝色发光水晶就是符咒。途中可以救出佣兵罗梭（佣兵ロ-スウ）、佣兵卡尔维（佣兵カルビ），宝箱里可以找到面包房之盾（パンやのタテ）和夜店之假面（よみせのおめん）。
进2号门后先过活动地板，接着上左侧平台，把怪兽扔到陷阱对面的开关上即可铺平道路。途中遇到的传送点按照右、左、左的顺序踩。门口处如果上右边平台则能救出格拉姆代理官（グラム代官）。宝箱里是洗衣粉（せんたくせっけん）。
3号门里出现一种幽灵般的敌人，吸收之后就获得了“灵光”（エクトプラズム），可以短时间灵魂出壳去探路。某些地方必须利用它，因为在实际通过时，很多地板看不到。这里可以救出木匠科克米戴尔（大エニコミチ-ル）和骑士孝普克罗奈（骑士コブクロ-ネ），从后者处习得拼死一击（デスペラ-ドアタック）。路上的宝箱里有尿壶（ぺんじょツボ）。
4号门内全是活动石台，细心跳跃即可。途中救出佐莫兹书记（ゾウモッシ书记）和士兵巴尔拜克（兵士バ-ベック），前者使得图书馆所藏后两类书可以阅读。宝箱里是坏笛子（こわれたフエ）。
此外，在3、4号门所在大厅内有一堵可以用保龄球打破的墙，三个宝箱分别是危机之剑（おききのつろギ）、传说之布（でんせつのぬの）和三百块钱。
现在达克雷背后的墙可以打开了，从中取得“优雅的茶色皮带（ゲイシャベルト）”这个传说武具，有了它就可以进行二段跳。这时再进双子山，在快到山顶的环行道附近用二段跳到达一处原来到达不了的石台，救出纺织女工艾兰奇（纺ぎ手エイランナ）。回城把传说之布给她，可以选择一种制品。第一项为传说的袋子（でんせつのわぶぐろ），可加强攻击力。
在教堂与霍怀德牧师（ホワイト牧师）交谈，约好凌晨2：00在教堂外见面。武藏如约而至，牧师说教堂的钟被盗，并用自己的背帮武藏爬上屋顶，跳进屋里。武藏一落地，莉奇尔中尉（リキュ-ル中尉）就下令乱射一气，又叫来几只怪兽围攻。但天一亮，怪兽就全被阳光杀死。走出教堂，武藏从牧师手中接过飞虎爪（かぎづめロ-プ），从井口滑了下去。取得五轮书水之卷后，他用水之力渡过水面，搬起教堂的大钟，从右边洞口通过矿坑将钟运回村子。牧师取走钟的同时，把天使像（てんしのぞう）送给武藏。用它能打开酒场地下那道门。
走进石门，武藏先后用水之力渡过水池、浇灭火炎（要连续用水珠攻击），最后找到了封印水之纹章的怪物。
这个BOSS前后共放出三只火精灵，必须用水之力进行攻击，每消灭一只火精灵，BOSS就会倒下片刻，趁此机会用兰罡多击打它额头的亮斑即可。
第四章
就在武藏奋勇拼杀的同时，被困于鲁·科阿尔帝国内的弗莱姬公主也正设法自救。她利用身边的比塔特结晶再次念动召唤咒，不料正要与武藏决斗的小次郎（ユジロ-）出现了。他很快被时髦首领托波所利用，要在这异度空间与武藏一战。
另一方面，毫不知情的武藏正走进睡魔森林，在小水池的中央就是被解放了的水之纹章。他站在纹章上发动水之力，池子马上干枯了，宝箱内正是传说的武具——（エキシヤゴ-グル）可以自动鉴定物品。
随后村长的妻子委托武藏处理水井干枯的问题（谈话中先选第2项，水位会发生变化。原来在水面上和水面下的两个宝箱分别装着武士的灵魂（サムライダマシイ）和军靴（ぐんじブ-ツ），前者是令蓄气速度加快的传说武具。
突然，天才首领艾德（天才リ-ダ-エド）和巨汉首领本恩（巨汉リ-ダ-ベ-ン）出现了，原来他们就是偷钟贼。
武藏走出矿坑，向村长的妻子复命，谁知又要去（スクラップ置き场）取齿轮来修理缆车。先回城与工匠茨凯冈戴尔和木匠科克米戴尔以及师傅马尔德雷交谈，然后进入矿坑，再次跳到排气扇下，但这回要向右走。在最深处的洞里放着4个齿轮，拿取右起第二个再与执事尤凯尔交谈即可。
武藏小憩片刻便去找村长，不料村庄已化为一片火海。他立刻发动水之力，将10处起火点逐一扑灭（水之力发动后对准火舌按住“□”键直至扑灭）。梢加调查之后，得知曾有两个可疑人物在起火前出没于村中，难道又是那两个盗贼？
天亮以后武藏终于见到了村长，从而得到了历法表（カレンダ-），村长的妻子又送了一袋粗盐（あらじお）。后者可将甘流岛（ガンリュ—岛）入口处挡路的岩石化作一只小虫。前行不远即救出冶炼屋的托克（冶炼屋のトック），他会在城里帮武藏打制“真雷光丸”。而水之纹章被打开后，武藏找到了五轮书·火之卷。与此同时，小次郎前来挑战，并以弗莱姬相要挟，武藏只能应战。
弗莱姬与武藏一起回城，见过执事尤凯尔，得知盗贼的骚扰成为相当严重的问题。武藏便同意去捣毁他们的巢穴。
先与佣兵米诺、佣兵卡尔维、佣兵罗梭交谈，了解到到则的巢穴就在彷徨森林深处的冰宫殿，而通过彷徨森林的方法与将棋棋有关。在图书馆翻阅资料之后，武藏就按照左、上、上、右、上、上、右、上、上、左、再一直向上的路线进入冰宫殿。
冰宫殿一层
1.救出厕所的尼克吉尔（便所のニクジル）。
2.门要用蓝眼（ブル-アル）打开。
3.将屋里敌人全灭就能从箱子里取得红眼（レッドアイ）。
4.救出科波尔·希福（ク-パ-·シュフ）
5.宝箱中取得素敌之杖（てきなステッキ）
6.让房间里的巨人将武藏扔起来可以到达二层。
7.要用红眼打开门。
8.宝箱里有艾德的兜裆布（エドのふんどし）。
冰宫殿二层
1.保持满血的前提下全歼敌人可获得蓝眼。
2.救出炼金术士沃尔特（炼金术士ウルテ）。
3.要通过些处的钢针地面，必须吸收12处那个砸人的大铁块，从而获得特技金刚不死身（スチ-ルボデイ），发动后即可撞出一条路。
4.获得传说的武具“希可克鞋”（ヒキャクシュ-ズ），可以走上冰冻的斜坡。
5.救出厨师哈拉敏（肉切りハ-ラミン）。
6.先在别处吸收那种模仿武藏动作的敌人，获得假人（ダミ-だコリャ）特技。在此屋中安放一个，待巨人走近时引爆，即可得到绿眼（ワリ-ンアイ）。
7.救出彬彬单身汉乐手（ビビンバッハ乐士）。
8.使用绿眼开门。
9.先用火之力烧化冰层再用红、绿、蓝三只眼球开门。
10.用火之力跳起，引燃两个灯台，下层的宝箱里有托博的手绢（トボのハンカチ）。
11.调查亮斑就会落下与封印火之纹章的冰龙战斗。路上的冰尖要用火之力烤化。
第五章
随着冰龙的灭亡，两个盗贼也遇上了麻烦。沃卡大佐对艾德和本恩的失败非常生气，二人只有苦苦哀求下一次机会。而此时的武藏也并不轻松，村长告诉他，弗莱姬公主向村里征收了许多钱。再向各商店主一问，原来是集资维修缆车，可是数目却高得惊人。武藏心中疑窦顿生，立刻去找执事尤凯尔。不料他对此事也并不知情，而公主本人已离开亚克伊尼克城，前往蒸汽树。武藏找到菲里斯的家却不见他本人，最后在蒸汽数门外发现被打晕的他。他说是弗莱姬要破坏蒸汽树，爆炸的危险又一次降临，并把开门用的零号阀门（0ばんハンドル）给了武藏。一进门，“弗莱姬”还想蒙混，可武藏早已发现她裙子底下的尾巴。原来这个“公主”是时髦首领·托波假扮的。她见事情败露就丢下骗来的钱财逃之夭夭。而蒸汽树爆炸的时间更近了。
这回关阀门与上次类似，只是有几个被拆下来了，最好先收集齐再逐一关闭。成功之后，武藏把集资款交还给村长。
现在要从矿坑进入原来的井底蓄水池（アミヤク村蓄水池），在旁边的侧洞内打开火之纹章，宝箱里是烹调锅（おりぁうりナベ），让爆发的火柱冲破洞顶的泥土，就能爬上去取得五轮书·风之卷。发动风之力以后再按攻击键就是旋风攻击，既可以抵消狂风的阻力又可以钻破某些松软的地面。武藏本想钻开条道路，不料贯穿了岩石，摔下彷徨森林，刚好掉到莉奇尔中尉和布兰迪大尉（ブランディ大尉）面前。莉奇尔立即不他封进绿水晶，结果由于没有兰罡多反而对武藏什么都干不了。等二人离开，武藏就从里面打碎了水晶。
一进村就听说缆车站出事了，原来是只大爬虫在捣乱。于是武藏从亚克伊尼克城乘上缆车，给了爬虫一记重击。受伤的虫子爬上山坡，敲破排气扇之后消失在洞中。武藏尾随而至，用风之力吹散毒雾，向洞穴深处走去。途中他救出穆什·瓦克尤，宝箱中拿到矿工的镐（こうふのつろはし），用地之力震落岩石铺平道路，进入一处积满有毒废液的山洞。宝箱里是坏油灯（こわれたカンデラ）。从这里先向右上方的洞口走，用风之力冲破狂风区，吸收“跳步”通过斜坡和尖刺地面。后面一处要留心些，先放出雷光丸刺中妖花。然后立即跳过深沟，这样仍有时间吸收特技。
不远处又是一部排气扇，用兰罡多打开电源就能登上左边的洞口，深入爬虫的老巢。武藏一路左行，救出音乐团长巴拉扬（音乐团长バラヤン）和骑士团长坦希奥奈（骑士团长タンシオ-ネ）。后者会传授坦希奥奈的穿宫杀（タンシオ-ネ·タロスアタック）。最后用风之力钻透地面，就回到了废液洞。此时再走右下的洞口，乘上滑行车，在尽头处钻开地面，见到了封印着风之纹章的怪兽。
对这个BOSS不能急于攻击，首先得学会躲。当它的头垂下时再用兰罡多打它的头部亮点。来回几次，它的尾尖就会发光，这时用旋风斩攻击它即可。
第六章
打开的风之纹章上刮起一阵龙卷风，武藏被抛到村旁边的森林里。这时约翰和雷诺再次出现，把约翰的笔记（ジヤンのメモ）交到他手中。按着那上面的提示，武藏在“空”的日子里（即当天的标志为空）走进蒸汽森林。等到7：00钟，天空下起了大雨。他先打开地之纹章震落岩石，接着爬上崖顶打开了风之纹章。一股旋风把他带上飞空塔。
塔共三层：第一层要用地之力砸下三个开关（每个砸两下），再用水之力跳进大门；第二层需点燃三个火堆；第三层就是五轮书·空之卷。发动空之力后只要按住“×”键就可以浮在半空。
此时，鲁·科阿尔帝国的云间城堡来到近前，它吸光了飞空塔的比邱塔特能源。无畏的武藏乘机打进内部，决心救出公主。
前面的一段路只要善用空之力即可通过，打败巨汉首领·本恩之后会进入传送室，来回穿过墙壁即被传送，从再次走出房门开始就要按照村长所赠的历法表上记载的顺序进门，而且必须灵活运用五种力量。有的开关要用地之力多砸几下，有一处需浮空片刻才能通过。进入空之纹章的门以后，只能下落一层并向右走，出口处的门没有任何标记。
紧接着，武藏打败了天才首领艾德，闯过帝国机械士兵的重重封锁，来到托波的舞台。这里必须按照音乐的节拍按键，奏出与托波相同的乐曲，急不得，慢不得。不久，封引空之纹章的机器塔出现了，泛着绿光的椭圆窗口是它的弱点。
帝国最高首领泰奇拉总统眼看着重重机关尽数被破，只好用弗莱姬这最后一张王牌交换武藏手中的兰罡多。突然沃卡大佐半路杀出，揭露出泰奇拉轼君篡位的恶性。原来他就是帝国的王子，那个曾被锁在阿米亚克伊村的约翰。可惜他忽视了身后的波尔多少尉……事到如今武藏也只能交出兰罡多换回弗莱姬。可是连泰奇拉也没想到，自己会成为由他亲手解放的暗之魔人的第一个牺牲品。那柄费尽心机得来的兰罡多很快回到武藏手中。
“什么是英雄武藏的纹章？约翰早点告诉我就好了！”武藏心里想着，一个空翻跃上石台，身后传来魔人那沉重的脚步声。可巧小次郎又来挑战，结果被魔人吸入体内，从而使魔人进化。当武藏找到被吹飞的弗莱姬时，身后已经没有任何退路了。
对付魔人第二形态关键在于绕圈子。在保持一定距离的情况下坚持跑圆圈，等它用尾巴攻击之后（只要距离算准就根本打不着）马上返身跃起大他额头上的晶体，4次之后就躲到它身体下面，如果它喷火就不动，如果它砸地就撤出影子并防御，随后它要喘气，乘机赐它一刀兰罡多。接下来还是绕圈……
最终形态的魔人相当灵活，有好几种攻击手段。每完成一种之后它会回到场地中心稍停瞬间，且体色变百。必须抓住这时机掷出雷光丸吸收它，成功之后它会变成球形，接着就是兰罡多的时刻了。
暗之魔人再次被打倒，兰罡多又回到螺旋塔的结界之内。勇敢的剑士武藏的传说还会继续流传。